Семинар МЛ геномики «Как функциональная геномика может помочь при исследовании эволюции?»

Дорогие коллеги!

Приглашаем Ваc на доклад Артёма Касьянова, Assistant researcher, HUMANEVOL Group, BIOPOLIS-CIBIO, Vairão, Portugal, который расскажет о своей работе "Как функциональная геномика может помочь при исследовании эволюции?".

Абстракт: Последние два десятилетия можно считать революционными для технологий секвенирования. Увеличение их производительности привело к существенному увелечению скорости накопления биологических данных и превращению биологии в науку «богатую данными». Основным типом данных, который оказался фундаментом этих изменений, стали полногеномные последовательности для различных видов. Они позволили полностью преобразить поплуяционную генетику и молекулярную эволюцию. Однако наряду с этим большой прогресс наблюдался и в области функциональной геномики. Появилось большое количество так называемых ОМИКСных технологий, таких как RNA-seq, ChIP-seq, Hi-C, бисульфитное секвенирование.  Эти технологии позволили получить информацию о функциях генов, регуляторных элементов и других геномных структур. В результате, новые функциональные данные стали важным дополнением к полногеномным последовательностям, и их использование может дать новую степень свободы для работ посвященных исследованию эволюции.
В своём докладе я хочу представить два подхода, которые призваны продемонстировать как функциональные данные могут быть использованы  для исследования эволюционных процесов, как на макроэволюционном, так и на микроэволюционном уровнях. Первый подход стал основой программы ISSEM, которая позволила осуществить межвидовые сравнения профилей экспрессии генов и на их основе получить новые сведения о процессах неофункционализации и субфункционализации в ходе видообразования. Второй подход основан на использовании данных о метаболических и сигнальных путях для детектирования событий положительного отбора в различных популяциях.

Ссылка на видеовстречу: https://telemost.yandex.ru/j/53039387975230