Функции до сорока процентов микробных генов до сих пор остаются неизвестными. Этот обширный слой генетической «темной материи» потенциально скрывает уникальные биологические системы, изучение которых критически важно как для фундаментального понимания принципов жизни, так и для создания инновационных биотехнологических инструментов. Основной целью нашей научно-учебной группы является дешифровка «языка генома» — механизмов кодирования биологической информации, основанных на анализе геномного и эволюционного контекста.
В центре нашей деятельности находится разработка новых вычислительных методов для крупномасштабной функциональной идентификации генных кластеров и комплексной характеризации геномов. Отличительной чертой нашего коллектива является сочетание глубокой экспертизы в области алгоритмической разработки и доказанного опыта практического анализа сложных биологических данных. Мы стремимся выйти за рамки создания отдельных инструментов, формируя всеобъемлющую базу данных геномных кластеров, которая позволит систематизировать знания о функциональном разнообразии в сложных микробных сообществах.
Наши исследования проводятся на стыке вычислительной биологии, современных подходов машинного обучения и технологий высокопроизводительного поиска генов. Мы применяем разработанные ресурсы для выявления новых регуляторных механизмов и идентификации перспективных генов-кандидатов. Результаты работы группы призваны заложить фундамент для создания новых стратегий противомикробной терапии и стать источником вдохновения для разработок следующего поколения в области синтетической биологии и современной биотехнологии.