Семинар МЛ геномики «Регуляция и прогностическая значимость сплайс-вариантов CD44 при колоректальном раке»
В четверг, 23.10.2025 в 14:40 пройдет семинар международной лаборатории статистической и вычислительной геномики.
Дорогие коллеги!
Приглашаем Вас послушать аспиранта ФББ НИУ ВШЭ Виктора Новосада, который расскажет о своей диссертации "Регуляция и прогностическая значимость сплайс-вариантов CD44 при колоректальном раке".
Аннотация.
Семинар будет посвящён алгоритму SRPseq - интерпретируемому методу моделирования регуляции альтернативного сплайсинга. Метод рассматривает переключение изоформ как последовательность решений на узлах двоичного дерева и объединяет два источника признаков: экспрессию РНК-связывающих белков и мотивы их связывания. На примере гена CD44 показана связь изоформного баланса с клиническими исходами при колоректальном раке. Разбирается полный аналитический пайплайн: подготовка публичных данных РНК-секвенирования, извлечение признаков, обучение и валидация модели, а также ограничения и переносимость между опухолевыми тканями.
Семинар пройдет в очном формате:
- Покровский б-р, 11, ауд G423
Ссылка для онлайн подключения:
https://telemost.yandex.ru/j/82894409816524