Семинар МЛ геномики «Коалесцентные деревья и частоты аллелей»
В четверг, 25.09.2025 в 14:40 пройдет семинар международной лаборатории статистической и вычислительной геномики.
Дорогие коллеги!
Приглашаем Ваc на доклад Егора Лаппо (Stanford University) "Коалесцентные деревья и частоты аллелей"
Аннотация: Коалесцентная теория описывает генеалогию нейтрального локуса для случайной выборки из популяции. Поскольку сами генеалогические деревья нельзя напрямую "увидеть" в выборке генетических последовательностей, интерпретация данных обычно происходит путём вычисления некоторых сводных статистик, связывающих наблюдаемые паттерны полиморфизмов с различными характеристиками генеалогий. В данном выступлении, я дам теоретический обзор основных переменных коалесцентной теории ($F_{ST}$, $f_4$, Tajima's $D$, и др.) с фокусом на связи демографических и адаптационных процессов с длинами ветвей коалесцентных деревьев. Затем, на примере собственных работ, я покажу как теоретические результаты могут быть применены к методологическим вопросам статистического анализа генетических данных.
Семинар пройдет в очном формате:
- Покровский б-р, 11, ауд G423
Ссылка для онлайн подключения:
https://meet.google.com/ekd-hfwk-kmg