Семинары
Событие: Семинар НУГ
Дата: 12.03.2026
Место: Очное проведение в аудитории S932 в 16:20
Место: Очное проведение в аудитории S932 в 16:20
Докладчики: Тюрина Е.Р.
Название: Подходы для взвешивания белков по белковым последовательностям
Аннотация: Геномные базы данных неоднородны, в связи как с перепредставленностью секвенированных организмов важных для здоровья или производства, так и с недостатком последовательностей для редких или недавно-открытых видов. Для изучения взаимосвязей между генами в геномных базах данных, необходимо нормализовать количества последовательностей по их представленности в геномах. В представленном докладе были озвучены основные подходы для нормализации количества последовательностей, используя таксономию, кластеризацию, выравнивания (Henikoff et al., 1994) и филогенетические деревья. Так же в докладе были озвучены перспективные подходы для решения этой задачи.
Презентация
Событие: Семинар НУГ
Дата: 26.02.2026
Место: Очное проведение в аудитории S932 в 15:30
Место: Очное проведение в аудитории S932 в 15:30
Докладчики: Комкова И.В.
Название: KAN сети для изучения свойств белков
Аннотация: Исследование применений сетей Колмагорова-Арнольда (KAN) для предсказания белковых взаимодействий. В докладе было рассказано о исследовании в котором был применён KAN для исследования молекулаярных свойств белков (https://www.nature.com/articles/s42256-025-01087-7). Были озвучены преимущества и недостатки подобного подхода для изучения белков. Так же была рассказана постановка задачи для дипломной работы по применению KAN для предсказания специфичности CRISPR-Cas белков к protospacer adjacent motiff (PAM) последовательностям.
Событие: Семинар НУГ
Дата: 05.02.2026
Место: Очное проведение в аудитории D501 в 16:20
Место: Очное проведение в аудитории D501 в 16:20
Докладчики: Зайцев С.В., Ким И.С.
Название: Методы оценки сетевых моделей, MLP и KAN архитектуры нейронных сетей.
Аннотация: В докладах было рассказано о стандартных подходах тестирования предсказания нейросетевых моделей (Accuracy, Precision, Recall, F1 Score, ROC Curve, AUC). Было рассказано о стандартных архитектурах нейронных сетей, методах градиентного спуска, multilayer perceptron (MLP), о Колмагорова-Арнольда (KAN) и их отличия от MLP.
Презентация (Ким)
Презентация (Зайцев))
Событие: Семинар НУГ
Дата: 29.01.2026
Место: Очное проведение в аудитории D504 в 16:20
Место: Очное проведение в аудитории D504 в 16:20
Докладчики: Козырёва Е.С. (Магистрант ИТМО "Прикладная геномика")
Название: CRISPR-Cas и anti-CRISPR белки - уникальная биологическая система, пути её изучения и применения
Аннотация: В докладе было рассказано о CRISPR-Cas системе, её функции и механизмах действия. Было рассказано о anti-CRISPR системах и о их методах действия для выключения CRISPR-Cas систем. Были рассказаны SOTA методы для поиска и характеризации подобных систем. Было рассказано о недаыно открытых RHH белках функционально связанных с anti-CRISPR системамим и их функциями, а так же предложен метод по поиску и характеризации RHH белков в anti-CRISPR локусах.
Презентация
Событие: Семинар НУГ
Дата: 20.01.2026
Место: Очное проведение в аудитории G423 в 16:20
Место: Очное проведение в аудитории G423 в 16:20
Докладчики: Гущин А. Д.
Название: High-Performance WebGL Phylogenetic Trees Viewer
Аннотация: Количество геномных данных растёт экспоненциально, что требует новых подходов для визуализации. Филогенетические деревья, например для SARS-COV-2, могут содержать миллионы листьев и существующие программные решения не способны отображать такие объемы данных. В докладе был представлен новый подход на базе WebGL для визуализации филогенетических деревьев. В ходе демонстрации была продемонстрирована способность создаваемого решения интерактивно отображать деревья с из десятками миллионов листьев.
Презентация
Нашли опечатку?
Выделите её, нажмите Ctrl+Enter и отправьте нам уведомление. Спасибо за участие!
Сервис предназначен только для отправки сообщений об орфографических и пунктуационных ошибках.